Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INTS3Q68E01 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms