Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLX4IPQ5VYV7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms