Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF6Q5VXH4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF6Q5VXH4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms