Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms