Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms