Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALFQ53S48 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms