Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRNQ4KMQ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms