Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms