Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms