Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MICAQ29983 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MICAQ29983 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MICAQ29983 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MICAQ29983 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MICAQ29983 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms