Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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