Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP6Q16828 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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