Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCK2Q16822 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms