Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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