Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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