Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNAPC1Q16533 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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