Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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