Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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