Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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