Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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