Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms