Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATXN8Q156A1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms