Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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