Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms