Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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