Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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