Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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