Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC10A1Q14973 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A1Q14973 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms