Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RAB39AQ14964 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RAB39AQ14964 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RAB39AQ14964 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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RAB39AQ14964 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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RAB39AQ14964 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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