Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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