Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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