Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CDH18Q13634 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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