Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
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