Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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