Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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