Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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