Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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