Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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