Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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