Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms