Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms