Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms