Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms