Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FMODQ06828 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FMODQ06828 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FMODQ06828 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms