Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBQ06643 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms