Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms