Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms