Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms