Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms