Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OC90Q02509 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OC90Q02509 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OC90Q02509 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms